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冈萨勒兹接管了神盾局以后并没有大肆清除异己什么的，菲兹因此“逃”了出来，并且拿着弗瑞的秘密盒子跑了出来。
这个盒子里装有神盾局大部分秘密信息，冈萨雷兹想要菲兹与珍玛将盒子打开，将里面的秘密公布出来，然而菲兹和珍玛却将盒子掉包，菲兹拿着真的盒子跑了出来。
智商超群的菲兹很快就找到了开启盒子的方法，并以此与科尔森取得了联系。
“长官，能不能先不说这个，我现在正被人跟踪，能不能教教我反跟踪技巧，让我先甩掉那两个家伙。”
“等等，菲兹……”一片嘈杂声后，只听科尔森道：“菲兹，我需要你重新回到基地。”
“啥？”菲兹一脸懵逼：“我刚刚才逃出来……”
“菲兹，我需要你回去报告一起九头蛇有可能制造的攻击事件。”
“九头蛇？难道不是先夺回神盾局？”菲兹不太明白科尔森是怎么想的。
“喔哦，相比于九头蛇，冈萨雷兹无疑是友好的。”
“他们的飞机已经起飞了，你能弄到飞机吗？”这时沃德的声音传了过来。
“沃德？”听到沃德的声音后，菲兹一愣：“沃德怎么会跟你们在一起？”
科尔森道：“这个我以后再跟你解释，现在你先回基地，我们一会儿就到。”
“我们也要回去？”亨特在科尔森身边道：“早知道如此，我们为什么还要逃跑……”
“难道你能弄到飞机吗？”科尔森反问了一句，道：“现在我们只能回到基地，跟冈萨雷斯谈判。”
既然是科尔森的命令，菲兹等人只能执行。
菲兹将自己的东西收拾好，走出了卫生间，然后坐到那两个跟踪他的特工旁边。
“我知道你们是冈萨雷兹派来监视我的，我想了想，我还是想回去继续做我的研究工作，你们知道的，好的工作其实并不好找……”
两个特工对视了一眼，都从对方眼中看出了不可置信，他们俩都没料到一个科研人员竟然已经发现他们是特工了！
既然被发现了，而且菲兹还要求回基地，两人只好再带着菲兹返回基地。
这边科尔森也坐上了车朝基地驶去。
沃德在前面开着车，亨特与科尔森坐在后排，亨特拿着手机看着迈克·彼得森传回来的视频。
迈克·彼得森经过另一个版本的绝境病毒改造，剔除了能发出高温的能力，快速愈合及断肢重生的能力也被剔除，只留下了强大的力气。
迈克在九头蛇设计的一次事件中被炸断了一条腿和一只胳膊，而他也被九头蛇找到并改造，一只眼睛替换成了电子眼，而亨特所看到的视频正是这只眼睛看到的视角。
“他们大概要去抓什么人……他说的那个什么纠缠是一个人？”亨特一头雾水地看着视频里的乔塞·李斯特与巴克希的对话。
“他说的量子纠缠相位传送”沃德给亨特解释了一句。
“OK，好好地开你的车！”亨特没好气地回了一句。
科尔森等人还没赶回基地，菲兹就已经回到了基地，他被带到了冈萨雷兹的办公室中，被冈萨雷兹单独接见，数据盒子也被放到了办公桌上。
“你已经解开了这个盒子？”冈萨雷兹看了眼桌子上的立方体小盒子问到。
“没有”菲兹果断撒谎。
“那你为什么又回来了？”冈萨雷兹继续询问。
“我接到了科尔森的信息，九头蛇在策划某种行动，科尔森似乎掌握了九头蛇的行踪，而且科尔森他们一会儿就会来基地。”
冈萨雷兹皱起眉头，科尔森这是在搞什么，让菲兹回来告诉自己，他会来攻击基地？可是科尔森应该没有人手了才对……
正在冈萨雷兹思考时，一个人走进了办公室，正是芭芭拉·摩尔斯。
看到芭芭拉欲言又止的样子，冈萨雷兹道：“芭芭拉特工，有什么就说吧，神盾局不再有秘密。”
“科尔森回来了，已经进入了基地。”
冈萨雷兹眉头舒展开，看向芭芭拉：“他是怎么进来的？”
“他们正大光明地走了进来……”
就在冈萨雷兹满脑子问号的时候，科尔森被带了过来。
冈萨雷兹看着被押过来的科尔森，他实在不明白科尔森到底打算搞什么鬼。
“科尔森，你就这么自投罗网……为了什么？”
“菲兹应该跟你说了，九头蛇，虽然我们的意见不同，但是我们对待九头蛇的立场是一致的，我一直在调查九头蛇剩下的蛇头，我找到了一个。”
没多久，神盾局几个高级特工就聚集到了这处办公室中，科尔森也将迈克电子眼的实时视频连接到了投影仪上。
“迈克已经打入了敌人内部，我们需要马上行动……”
视频中，迈克与巴克希和一队九头蛇士兵已经下了车，走进了一栋小楼之中，这栋楼荒废了有段时间了，里面一个人也没有。
冈萨雷兹看着视频，道：“恐怕已经来不及了。”
迈克打开了X光扫描模式，电子眼中看到一个房间中有一男一女两个人，迈克不打算真的给九头蛇干活，所以没有声张，反而在开门时故意弄出了声响。
听到声音，那房间中的一男一女立刻从房间中走了出来，正好与迈克对视到了一起。
“斯凯？”
“迈克？”
迈克和正在观看视频的科尔森等人完全懵了，他们没想到九头蛇的人想要抓斯凯。
斯凯，也就是黛西，她也有点懵，她没想到会在这里看到迈克。
迈克和斯凯同时愣住，但是迈克身边的巴克希却没有愣，巴克希立刻喝道：“你还在等什么！”
迈克握了握拳头，他很想转过身将身边这些九头蛇全干掉，但是想到科尔森给自己的任务，他只能举起了自己那只被改造的手臂，手臂一阵变化，两枚导弹露了出来。
“我特……法克……迈克！”正在观看视频的梅怒骂了一声。
迈克虽然举起了手臂，但是其迟迟没有发射，而他身边的九头蛇特战队员却举起了武器，其中一人的武器有点特殊，是一个发射器，那人直接朝斯凯开枪，一个奇怪的东西抛射向斯凯。
嗡！就在这时，斯凯抬起手，一股无形的波纹瞬间撞向了迈克和一帮九头蛇特战队员，那枚奇怪的武器也被弹了回去。
斯凯的震波很强大，迈克和一帮九头蛇特战队员直接倒飞了出去。
那枚特殊的武器也落到了迈克等人的周围，这武器一落地立刻发出四五条蓝色的能量弧，迈克等人一阵抽搐躺到了地上。
“我恨九头蛇！”
和斯凯在一起的男人正是其父亲卡尔·约翰逊，卡尔愤怒地就要上前去解决倒在地上的那些九头蛇，却被斯凯一把拉住。
“我们该走了！九头蛇肯定不止这么几个人。”
卡尔的脾气不怎么好，但是他非常听妻子与女儿的话，所以斯凯一制止他，他马上放弃去干掉那些九头特工的打算，拉起斯凯朝走廊的另一边跑去。
神盾局的办公室内一片安静，最后还是冈萨雷兹打破平静的气氛。
“她就是你的那个手下，斯凯？”冈萨雷兹看着科尔森，道：“暗自收集训练超能力者，你到底想干什么科尔森！”
“不管你信不信，我并没有暗自收集并训练超能力者”科尔森辩解到。
“迈克的位置开始移动了，没有视频信号传回来”梅打断了两人的话：“现在我们只能等待。”
冈萨雷兹趁机将装有秘密资料的小盒子递到了科尔森的面前，道：“现在，科尔森，你有一个证明自己的机会，神盾局不再有秘密！”